东莞理工学院与中科院高能物理研究所建立合作关系以来，双方竭诚合作，硕果累累。2009年我校与高能物理研究所签署了战略合作协议。近年来，双方联合建设了“中子探测与快电子技术联合实验室”、“中国散裂中子源机电技术研发联合实验室”、“中国散裂中子源先进材料联合实验室”、“下一代互联网联合实验室”，实现了四个重点建设学科与中科院高能物理研究所的全面合作。同时，中科院高能物理研究所与我校共同开发横向项目，现共计有“低温试验台制造与安装研究”等10个横向项目在研，经费近400万人民币。
两机构围绕中国散裂中子源（CSNS）项目的实际需要开展研究，包括散裂中子源相关机电技术计及开发，相关设备研制等。目前已开展的项目有CSNS靶站关键部件遥控维护技术及辅助工装开发、中子束窗遥控维护装置样机研制、低温试验台架制造和安装、中子束闸门插件更换装置研制、靶体插件水密封实验、热室遥控维护虚拟现实技术等。四个联合实验室目前主要以完善实验室基础设施和实验设备、搭建模拟实验平台为主，下一步主要从事与工程相关的关键技术项目研发和实验测试，解决工程建设技术问题，并通过联合培养研究生模式培养相关专业高水平研究人才和技术人员，促进学校教学和科技创新能力的发展。
